Przygody rodziny Nektonów, która mieszka na pokładzie łodzi podwodnej "Aronax" i, dysponując wysoko zaawansowanymi technologiami, wyrusza w niezbadane morskie odmęty. Bohaterowie troszczą się o podwodny świat, wiedząc, że grożą mu różne niebezpieczeństwa. Bronią się przed atakami pirackimi, zmagają z telewizyjnym gwiazdorem i walczą z firmami zanieczyszczającymi środowisko. Nektonowie próbują odnaleźć Lemurię, tajemniczą krainę, rzekomo zamieszkałą przez ich przodków.Bajau Laut, znani jako morscy koczownicy, zamieszkują wody Morza Południowochińskiego i skrywają tajemnicę związaną z ich stylem życia. Ant i Fontaine, poznając ten sekret, postanawiają pomóc tym niezwykłym ludziom. Ich zadanie polega na odkryciu sposobu na odnalezienie migrujących ryb, które są kluczowe dla przetrwania Bajau Laut.