Młodzi pasjonaci zjawisk paranormalnych i pracy detektywistycznej poszukują przygód, badając kulisy tajemniczych wydarzeń. Tchórzliwy pies Scooby Doo, jego bliski przyjaciel Kudłaty oraz Fred, Daphne i Velma podróżują Wehikułem Tajemnic, pomagając napotkanym osobom rozwiązywać różne zagadkowe sprawy.Przyjaciele rozwiązują zagadkę Profesora Hę, naukowca z przeszłości Freda. Rywalizuje z nimi Rose, koleżanka z dzieciństwa Jonesa.