Młodzi pasjonaci zjawisk paranormalnych i pracy detektywistycznej poszukują przygód, badając kulisy tajemniczych wydarzeń. Tchórzliwy pies Scooby Doo, jego bliski przyjaciel Kudłaty oraz Fred, Daphne i Velma podróżują Wehikułem Tajemnic, pomagając napotkanym osobom rozwiązywać różne zagadkowe sprawy.Młodzi detektywi jadą do miasteczka Salem w stanie Massachusetts na festyn historyczny. Na miejscu pojawia się zły duch, rzekomo wywołany przez czarownicę w ramach zemsty za słynne procesy czarownic z XVII wieku. Niebawem młodzi detektywi zaczynają być podejrzani, że to ich sprawka.